Allier'i departemangus on kolm arrondissementi. Prantsuse departemangud ja samalaadsed haldusüksused teistes riikides on jaotatud arrondissementideks, mida inglise keelde tihti tõlgitakse kui districts (mõnel juhul ka boroughs). Iga arrondissemendi halduskeskust nimetatakse alamprefektuuriks. Kui departemangu prefektuur (pealinn) asub sama nimega arrondissemendis, täidab see linn korraga nii prefektuuri kui ka alamprefektuuri funktsioone.
Arrondissemendid on halduslikud ja statistilised üksused, mida juhib alamprefekt (pr k sous-préfet). Need ei oma eraldi valitavat kogukondlikku kogu: nad koordineerivad riiklikke teenuseid, nagu politsei, halduspraktika ja mõningad sotsiaalteenused, ning lihtsustavad kohalike kommuunide (pr k communes) haldust. Traditsiooniliselt jagunevad arrondissemendid veel vallutavalt kantoniteks, kuid 2015. aasta kantonite ümberehitus muutis nende suhted ja piirid ning kantonite roll on peamiselt valimisprobleemide reguleerimisel.
Allier'i departemangu arrondissementid on järgmised:
- Moulins — departemangu prefektuur ja seega ka selle arrondissemendi halduskeskus. Moulins on Allier'i administratiivne keskus ja asub departemangu keskosas.
- Montluçon — alamprefektuurena teenib see linn läänepoolset osa Allier'st; Montluçon on piirkonna üks suuremaid linnu ja tähtis tööstus- ning teeninduskeskus.
- Vichy — alamprefektuur, kuulus kuurortlinn ja spaakeskus, mis paikneb departemangu lõunaosas ning on oluline turismi- ja tervishoiukeskus.
Arrondissemendid jagunevad omakorda kommuunideks, mis on Prantsusmaa väikseimad omavalitsusüksused ja kus asub otsene kohalik haldus ja teenuste osutamine. Allier (departemangu kood 03) ajalooline administratiivstruktuur on kujunenud alates 19. sajandi algusest (arrondisse mente kehtestati laialdaselt 1800. aastal) ning tänapäeval täidavad arrondissementid peamiselt haldus- ja statistilisi ülesandeid riikliku korralduse toetamiseks.