Wellcome Sangeri instituut – Suurbritannia genoomika- ja geneetikauuringute keskus

Wellcome Sangeri instituut — Suurbritannia juhtiv genoomika- ja geneetikauuringute keskus Cambridge'i lähedal, tipptasemel inimgenoomi, patogeenide, mudelorganismide ja bioinformaatika uuringud.

Wellcome Sanger Institute (varasemad nimed Sanger Centre ja Wellcome Trust Sanger Institute) on Briti mittetulunduslik genoomika- ja geneetikaalane uurimisinstituut. Seda rahastab peamiselt Wellcome Trust.

Instituut asub Wellcome Genome Campus'is Hinxtoni küla lähedal Cambridge'i lähedal. Kampuses asub ka Euroopa Bioinformaatika Instituut. Instituut loodi 1992. aastal ja sai nime kahekordse Nobeli preemia laureaadi Frederick Sanger'i järgi. See oli kavandatud laiaulatusliku DNA sekveneerimiskeskusena. See osales inimgenoomi projektis ja andis seejärel suurima üksikpanuse inimese genoomi kuldse standardjärjestuse koostamisse. Instituudi põhimõte on algusest peale olnud andmete jagamine ja ta teeb suurt osa oma teadustööst koostöös.

Alates 2000. aastast on instituut laiendanud oma missiooni, et mõista "geneetika rolli tervises ja haigustes". Praegu töötab instituudis umbes 900 inimest ja see tegeleb nelja peamise uurimisvaldkonnaga: inimgeneetika, patogeenigeneetika, hiirte ja sebrakalade geneetika ning bioinformaatika.

Uurimisvaldkonnad ja tähtsamad projektid

Wellcome Sanger Institute keskendub nii põhitõenduspõhisele teadustööle kui ka suurte andmekogude loomisele, mida kasutavad teadlased üle maailma. Peamised tegevusvaldkonnad hõlmavad:

• Inimgeneetika: haigusgiidide leidmine, populatsioonigenoomika ja geneetiliste variatsioonide tõlgendamine, et paremini mõista pärilikke haigusi ja kompleksseid mitmefaktorilisi seisundeid.
• Patogeenigeneetika: mikroorganismide genoomide sekveneerimine ja analüüs, et jälgida nakkushaiguste levikut, resistentsuse teket ja avaliku tervise vastuseid (näiteks osalus koroonaviiruse ja muude patogeenide genoomseire projektides).
• Loormudelite genoomika: hiirte ja sebrakalade geneetika, mis toetab funktsionaalset geneetikat ja haiguste molekulaarsete mehhanismide uurimist.
• Bioinformaatika ja andmeteadus: suurte genomandmete töötlemine, andmebaaside arendamine ning algoritmide ja töövoogude loomine andmete analüüsiks ja jagamiseks.

Tehnoloogia, infrastruktuur ja koostöö

Instituudis kasutatakse nii klassikalisi järjestamismeetodeid kui ka kiiret järgmist põlvkonna järjestustehnikat (next-generation sequencing). Wellcome Sanger on tuntud oma suure läbilaskevõime ja automatiseeritud laboriprotsesside poolest, mis võimaldavad kiiret ja suures mahus genoomiandmete tootmist.

Tugev koostöö teiste teadusasutuste, haiglate ja biotehnoloogiaettevõtetega on instituudi töös kesksel kohal. Kampuses asuvate asutuste — näiteks Euroopa Bioinformaatika Instituudi — lähedus soodustab tihedat rahvusvahelist koostööd ja andmevahetust.

Andmete jagamine, eetika ja avalik mõju

Instituudi põhimõte andmete jagamisest tähendab, et paljud genereeritud andmekogud tehakse kättesaadavaks teadlaskonnale üle maailma, järgides samal ajal rangeid andmekaitse- ja konferentsireegleid. Sanger on olnud eeskujuks avatud teaduse ja andmete standardite väljatöötamisel ning osalenud aruteludes geneetika eetiliste, juriidiliste ja sotsiaalsete aspektide kohta.

Wellcome Sanger on olnud ka oluline partner riiklikes ja rahvusvahelistes tervisealgatustes — näiteks genoomseire võrgustikes, mis aitavad tuvastada ja jälgida haiguspuhanguid ning uute viiruste ja variantide levikut. Selline töö on suurendanud avaliku tervise reageerimisvõimet ja teaduspõhist otsustamist.

Koolitus, suutlikkus ja tuleviku suunad

Instituut pakub koolitusi ja praktikavõimalusi nii teadlastele kui ka andmeanalüütikutele ning panustab järgmise põlvkonna genomika- ja bioinformaatikaspetsialistide väljaõppesse. Tulevikusuunad hõlmavad järjest täpsemaid fenotüpiseerimis- ja järjestamistehnikaid, integratsiooni mitmetest allikatest pärinevate andmete vahel ning geeni- ja genoomiandmete kasutamist meditsiiniliste rakenduste arendamiseks.

Kokkuvõtlikult on Wellcome Sanger Institute üks maailma juhtivaid genoomika- ja geneetika uurimiskeskusi, mille panus inimgenoomika, patogeenide genoomika ja bioinformaatika arendamisse on olnud märkimisväärne ning mille teadustöö ja andmejagamise põhimõtted mõjutavad laialdaselt kogu valdkonda.

Küsimused ja vastused

K: Mis on Wellcome Sanger Institute?

K: Kes rahastab Wellcome Sanger Institute'i?

K: Kus asub Wellcome Sanger Institute?

K: Kelle järgi on instituut nime saanud ja miks see asutati?

K: Milline oli instituudi panus inimgenoomi projekti?

K: Milline on instituudi teadustöö alates 2000. aastast?

K: Millised on instituudi neli peamist uurimisvaldkonda?

Otsing