Alternatiivne splaissing
Alternatiivne splaissing võimaldab DNA-l kodeerida rohkem kui ühte valku. See muudab sõnumitooja RNA eksoonide koostist.
Alternatiivse splaissingu puhul ühendatakse transkriptsiooni käigus toodetud eelsõnumi RNA eksonid RNA splaissingu käigus erinevalt.
See tekitab ühest ja samast geenist erinevaid küpseid messenger-RNAsid. Need transleeritakse erinevateks valkudeks. Seega võib üks geen kodeerida mitut valku.
Alternatiivne splaissing on eukarüootidel normaalne. See suurendab oluliselt genoomi poolt kodeeritavate valkude mitmekesisust. Inimesel on ~95% multieksoonilistest geenidest alternatiivselt splaissitud.
Alternatiivset splaissimist on mitmesuguseid: kõige levinum on eksoonide vahelejätmine. Teatud tingimustel või teatud kudedes võib ekson olla mRNA-s sisaldunud, kuid teistes tingimustes võib see mRNA-st välja jääda. On olemas splaissingu aktivaatorid, mis soodustavad konkreetse splaissimiskoha kasutamist, ja splaissingu repressorid, mis vähendavad konkreetse koha kasutamist. Leitakse uusi alternatiivse splaissingu tüüpe.
Haiguste puhul esinevad splaissingu ebanormaalsed variatsioonid. Paljud inimese geneetilised häired tulenevad splaissingu variantidest. Ebanormaalsed splaissingu variandid võivad kaasa aidata ka vähi tekkimisele. Mittetöötavate splaissingutoodetega tegeldakse tavaliselt transkriptsioonijärgse kvaliteedikontrolli abil. See tähendab, et neid tükeldatakse ensüümide abil.
Alternatiivse splaissingu tulemusena tekib kaks valgu isovormi.
Mitmekesisuse allikas
Alternatiivne splaissing (erinevate eksonite re-kombinatsioon) on eukarüootide geneetilise mitmekesisuse peamine allikas. Üks konkreetne Drosophila geen (DSCAM) võib alternatiivselt splaissida 38 000 erinevaks mRNA-ks.
Küsimused ja vastused
K: Mis on alternatiivne ühendamine?
V: Alternatiivne splaissing on protsess, mille käigus transkriptsiooni käigus toodetud eelviimase RNA eksonid ühendatakse RNA splaissingu käigus erinevalt, mille tulemuseks on sama geeni erinevad küpsed sõnumitooja RNAd, mis tõlgitakse erinevateks valkudeks.
K: Kui levinud on alternatiivne splaissing?
V: Alternatiivne splaissing on eukarüootidel tavaline ja suurendab oluliselt genoomi poolt kodeeritavate valkude mitmekesisust. Inimesel on umbes 95% multieksoonilistest geenidest alternatiivselt splaissitud.
K: Millised on mõned alternatiivse splaissingu liigid?
V: Kõige tavalisem alternatiivse splaissingu tüüp on eksooni vahelejätmine, mille puhul võib ekson olla mRNAsse lisatud või välja jäetud sõltuvalt teatud tingimustest või kudedest. On ka teisi tüüpe, nagu splaissingu aktivaatorid ja repressorid, mis vastavalt soodustavad või vähendavad teatud kohtade kasutamist, samuti on avastamisel uusi tüüpe.
K: Kuidas mõjutab alternatiivse splaissingu ebanormaalne varieerumine tervist?
V: Alternatiivse splaissingu ebanormaalsed variatsioonid võivad põhjustada geneetilisi häireid ja aidata kaasa vähi arengule. Selle protsessi käigus tekkivate mittetoimivate toodetega tegeldakse tavaliselt transkriptsioonijärgse kvaliteedikontrolli abil, kus ensüümid neid tükeldavad.
K: Milliseid valke saab alternatiivse splaissingu abil luua?
V: Alternatiivse splaissingu abil võib üks geen kodeerida mitut valku, mis suurendab genoomi poolt kodeeritavate valkude mitmekesisust.
K: Mis juhtub, kui alternatiivse splaissingu tulemusel tekivad mittetoimivad tooted?
V: Kui alternatiivse splaissingu tulemusel tekivad mittetoimivad tooted, siis tegeletakse nendega tavaliselt transkriptsioonijärgse kvaliteedikontrolliga, kus ensüümid neid tükeldavad.
