Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii on endosümbiootiline gammaproteobakter. Sellel on väikseim teadaolev genoom kõigist bakteritest.
See liik on endosümbiont, mis esineb kõigil psülliididena tuntud floemimahla toitvate putukate liikidel. Endosümbiont esineb spetsiaalses struktuuris, mida nimetatakse bakterioomiks.
2006. aastal analüüsiti ühe tüve Ca. C. ruddi genoomi sekveneeriti Jaapanis RIKENis ja Arizona Ülikoolis. Genoom on 159 662 aluspaari pikkune ringikujuline kromosoom, millel on suur kodeerimistihedus (97%), palju kattuvaid geene ja vähendatud geenipikkus. Ennustatud geenide arv oli 182, mis on samuti madalaim registreeritud arv (NCBI-Genome). Arvukad eluks hädavajalikuks peetavad geenid näivad puuduvat, mis viitab sellele, et see liik võib olla saavutanud organellitaolise staatuse.
Võrdluseks: Mycoplasma genitalium, mille genoom on vabalt elavatest organismidest kõige väiksem, koosneb 521 geenist.
Küsimused ja vastused
K: Mis on Candidatus Carsonella ruddii?
V: Candidatus Carsonella ruddii on endosümbiootiline gammaproteobakter, mis esineb kõigis floemimahla toitvate putukate liikides, mida nimetatakse psüllidideks.
K: Kui suur on Candidatus Carsonella ruddii genoom?
V: Candidatus Carsonella ruddii genoom on väikseim teadaolev bakteri genoom ja koosneb 159 662 aluspaarist koosnevast ringikujulisest kromosoomist.
K: Mitu geeni on Candidatus Carsonella ruddii's eeldatavasti olemas?
V: Candidatus Carsonella ruddii prognoositud geenide arv on 182, mis on väikseim teadaolev arv (NCBI-Genome).
K: Milline on Candidatus Carsonella ruddii genoomi kodeerimistihedus?
V: Candidatus Carsonella ruddii genoomi kodeerimistihedus on kõrge, 97%.
K: Mis on bakterioom?
V: Bakterioom on Candidatus Carsonella ruddii spetsialiseerunud struktuur, kus esinevad endosümbiondid.
K: Mis puudub Candidatus Carsonella ruddii genoomis?
V: Candidatus Carsonella ruddii genoomist näivad puuduvat mitmed eluks hädavajalikuks peetavad geenid, mis viitab sellele, et see liik võib olla saavutanud organellitaolise staatuse.
K: Kuidas on Candidatus Carsonella ruddii genoom võrreldav Mycoplasma genitalium'i omaga?
V: Mycoplasma genitalium'i genoomis, mis on kõige väiksema genoomiga vabalt elavatest organismidest, on 521 geeni, mis on oluliselt rohkem kui Candidatus Carsonella ruddii prognoositud geenide arv.
