SARS-CoV-2
SARS-koronaviirus 2 (SARS-CoV-2) on positiivse tähendusega, üheahelaline RNA-koronaviirus, mis põhjustab haigust COVID-19. Varem nimetas Maailma Terviseorganisatsioon (WHO) seda 2019. aasta uueks koronaviiruseks (2019-nCoV) (hiina keeles: 2019新型冠狀病毒).
See viirus alustas 2019-20 koronaviiruse puhangut. Esimestest kahtlustatavatest juhtumitest teatati WHO-le 31. detsembril 2019.
Paljud selle uue koronaviiruse esimesed juhtumid olid seotud Huanani mereandide hulgimüügituruga, mis on suur mereandide ja loomade turg Hiinas Wuhanis. Viirus võis olla pärit nakatunud loomadelt. Ei ole kindel, et see koht oli pandeemia allikas.
Koronaviirus
Origins
Selle viiruse geneetiline materjal näitas palju sarnasusi SARS-CoV (79,5%) ja nahkhiirte koronaviirustega (96%). See tähendab, et viirus võis algselt pärineda nahkhiirtest. Teadlased tegid veel katseid, mis näitasid, et viirus läks tõenäoliselt nahkhiirtest vaheperemeheks, st mõnele muule loomale nahkhiirte ja inimeste vahel. Selle teise looma viirused muutusid aja jooksul, kuni nad suutsid inimest nakatada. Teadlased on peaaegu kindlad, et algne loom oli nahkhiir, kuid ei ole kindel, milline oli vahepealne loom. Mõned teadlased arvavad, et see võis olla pangoliin, sest pangoliinides elavad koronaviirused, kuigi need ei ole täpselt samad, mis SARS-CoV-2 või nahkhiirte omad. Pangoliinid on ohustatud liik ja nende ostmine, müümine või ühest kohast teise viimine on Hiinas ja paljudes teistes riikides ebaseaduslik. Kuid nende soomused on paljude traditsiooniliste Hiina ravimite koostisosa, mistõttu neid müüakse sageli mustal turul.
Nimi
2020. aasta veebruari alguses andis rahvusvahelise viiruste taksonoomia komitee koronaviiruste uurimisrühm SARS-CoV-2 ametliku nime, mis tähendab äkilise ägeda hingamisteede sündroomi koronaviirust number kaks. Enne seda nimetati viirust "2019-nCoV", mis tähendab "2019. aastal ilmunud uut (uut) koronaviirust". Uurimisrühm valis selle nime, sest uus viirus oli nii sarnane teise viirusega, mida juba nimetati SARS-CoV ilma numbrita.
3D-animatsiooniga SARS-CoV-2 viirus
Kuidas viirus põhjustab haigust
Kopsude laienevas osas, kopsualveoolides, on kaks peamist rakutüüpi. Üks rakk, tüüp I, absorbeerib õhust, st gaasivahetus. Teine, II tüüp, toodab pindaktiivseid aineid, mis aitavad hoida kopsud vedelad, puhtad, infektsioonivabad jne. COVID-19 leiab tee II tüüpi surfaktante tootvasse rakku ja lämmatab selle, paljundades selles COVID-19 viiruse. Iga II tüüpi rakk, mille viirus tapab, põhjustab kopsudes äärmusliku reaktsiooni. Vedelik, mädanik ja surnud rakkude materjal ujutavad kopsu, põhjustades koronaviiruse kopsuhaigust.
Kopsukahjustus
Teadlased uurisid COVID-19-sse surnud inimeste kopsusid. Nad võrdlesid neid inimeste kopsudega, kes surid A-grippi, ja inimeste kopsudega, kes surid, kuid kelle kopsud ei kannatanud mingi probleemi tõttu. Nad nägid, et COVID-19 patsientide kopsudes olid kopsude veresoonte nahkade rakud tugevamini kahjustatud ja verehüübimist oli rohkem. Kõige olulisem erinevus, mida teadlased nägid, oli see, et kopsud olid hakanud kasvatama uusi veresooni.
COVID-19
2020. aasta veebruaris teatas Maailma Terviseorganisatsioon, et nad on valinud SARS-CoV-2 põhjustatud haigusele nime: COVID-19. "Covi" tähistab "koronaviirust", "D" tähistab "haigust" ja "19" tähistab aastat 2019. Nad ütlesid, et nad ei taha, et nimes sisalduks mõni inimene, koht või loom, näiteks "Wuhan" või "pangoliin", sest siis võivad inimesed süüdistada haiguse eest seda kohta, inimest või looma. Samuti soovisid nad, et nime oleks lihtne valjusti välja öelda.
Sümptomid
Ameerika Ühendriikide haiguste kontrolli ja ennetamise keskuse andmetel põhjustab COVID-19 inimestel erinevatel viisidel haigestumist, kuid tavaliselt mõjutab see kopsusid. Tavaliselt köhivad inimesed ja neil on hingamisraskused. Sageli on neil ka palavik, külmavärinad, peavalu, lihasvalu või maitse- või lõhnaprobleemid.
Ameerika Gastroenteroloogide Assotsiatsiooni 2020. aasta aprilli uuringu kohaselt võib COVID-19 põhjustada haigete inimeste oksendamist või kõhulahtisust, kuid seda esineb harva. Nad ütlesid, et umbes 7,7% COVID-19 patsientidest oksendas, umbes 7,8%-l oli kõhulahtisus ja umbes 3,6%-l oli kõhuvalu.
Shape
SARS-CoV-2 viirus näeb välja nagu ümmargune pall, millel on ümberringi piigid. Viirusel on neli osa: piigid, membraan, ümbris ja viiruse geneetiline materjal ehk ribonukleiinhape (RNA). Iga neist neljast osast on erinev valgumolekul. Piike, membraani ja ümbrikku nimetatakse koos viiruse ümbrikuks ehk viiruse väliskihiks.
Spike'i valk kleepub inimese raku kohale, mida nimetatakse retseptoriks. Seda retseptorit nimetatakse angiotensiini konverteerivaks ensüümiks 2 (ACE2). ACE2 leidub kopsude, neerude ja soolestiku rakkudes. Pärast seda, kui piikvalk kleepub ACE2 retseptori külge, ühinevad viirus ja rakumembraanid omavahel.
SARS-CoV-2 on positiivne RNA-viirus, mis tähendab, et ta kasutab ribonukleiinhapet (RNA), et hoida mustreid, mida ta vajab valkude valmistamiseks, mitte aga DNA-d, nagu inimesed ja teised mitmerakulised elusolendid.
Vandenõuteooriad
2020. aasta alguses hakkasid mõned inimesed arvama, et SARS-CoV-2 võis olla tahtlikult valmistatud Wuhani viroloogiainstituudi laboris ja lastud Wuhanis vabaks nagu relv. Kui Iraani juht ajatolla Khamenei ütles, et ta ei soovi, et Ameerika Ühendriigid aitaksid tema riiki koronaviiruse vastu, nimetas ta ühe põhjusena ideed, et ameeriklased on teinud viiruse tahtlikult, et kahjustada iraanlasi: "Ma ei tea, kui tõene see süüdistus on, kuid kui see on olemas, siis kes mõistusega usaldaks teile ravimeid tuua?" ütles Khamenei.
Üks Pew Researchi uuring näitas, et 29% vastanud ameeriklastest arvas, et SARS-CoV-2 võis olla valmistatud laboris tahtlikult ja 23% arvas, et see võis olla valmistatud laboris juhuslikult. Ühendkuningriigis läbiviidud küsitlus näitas, et paljud arvasid, et COVID-19 on põhjustatud 5G traadita võrkudest.
17. märtsil 2020 avaldasid Columbia Ülikooli ja teiste paikade teadlased ajakirjas Nature Medicine artikli, milles näitasid, et SARS-CoV-2 ei ole peaaegu kindlasti inimeste poolt laboris valmistatud. Nad tegid seda erinevate viiruste genoomide omavahelise võrdlemise teel. Teadlased nägid, et SARS-CoV-2 ei sobinud ühegi viroloogide jaoks juba olemasoleva viiruse selgrooga.
Ravimid
2020. aasta aprillis teatasid Pittsburghi ülikooli teadlased, et nad on valmistanud vaktsiini nimega PittCoVacc ja katsetasid seda hiirtel.
Teine teadlaste rühm, mida juhib dr Josef Penninger Briti Columbia ülikoolist, leiutas ravimi nimega APN01 ja katsetas seda konstrueeritud inimkoes, st inimrakkudes, mis on laboris kokku pandud nii, et need näeksid välja ja toimiksid nagu kehas. Teadlased said teada, et inimese lahustuva rekombinantse angiotensiini konverteeriva ensüümi 2 (ACE2) lisamine nendesse SARS-CoV-2-ga nakatunud kudedesse raskendas viiruse paljunemist.
2020. aasta aprilli lõpus teatas Oxfordi ülikooli töörühm, et nad on välja töötanud COVID-19 vaktsiini. Ameerika Ühendriikide Riiklikud Tervishoiuinstituudid katsetasid seda reesusahvide peal ja see toimis. Oxfordi teadlased ütlesid, et kuna nad olid juba töötanud teise koronaviiruse vastu mõeldud vaktsiini kallal, oli neil eelis, et töötada SARS-CoV-2 vastu mõeldud vaktsiini kallal. Teadlased ütlesid, et nad püüavad oma vaktsiini katsetada 6000 inimesel 2020. aasta mai lõpuks ja et nende vaktsiin võiks olla inimeste jaoks valmis 2020. aasta septembris.
2020. aasta mai keskel teatas ettevõte nimega Moderna, et nad testisid oma mRNA-vaktsiini neljakümne viiel inimesel ja kaheksa neist tekitasid antikehi, kuid nad ei avaldanud konkreetseid andmeid ega avaldanud artiklit teadusajakirjas. Anna Durbin Johns Hopkinsi ülikoolist ütles, et on liiga vara öelda, kas inimesed säilitavad antikehad piisavalt kaua, et vaktsiin toimiks. Ameerika Ühendriikide toidu- ja ravimiamet andis Modernale loa katsetada vaktsiini uuesti rohkematel inimestel. Moderna meditsiiniline juht ütles, et vaktsiin võib olla valmis 2021. aasta jaanuaris.
Hüdroksüklorokiin
Mõned inimesed arvavad, et hüdroksüklorokiin, ravim, mida manustatakse malaaria, luupuse ja artriidi all kannatavatele inimestele, võib toimida COVID-19 vastu, mõned aga mitte. Üks Hiinas läbi viidud uuring näitas, et hüdroksüklorokiini võtnud COVID-19 patsientidel paranes olukord kiiremini, kuid uuringut ei ole refereeritud. Teised uuringud Prantsusmaal ja Hiinas näisid näitavat, et hüdroksüklorokiin aitas, kuid uuringutes ei olnud kontrollrühmi, mis tähendab, et arstid ei võrrelnud patsiente, kes võtsid hüdroksüklorokiini, patsientidega, kes seda ei võtnud, nii et nad ei saanud olla kindlad, kas see oli hüdroksüklorokiin, mis neid aitas, või kas see oli midagi muud. Märtsis andis Ameerika Ühendriikide toidu- ja ravimiamet arstidele loa anda hüdroksüklorokiini COVID-19 patsientidele.
Ameerika Ühendriikide president Donald Trump pakkus välja, et malaariaravim hüdroksüklorokiin võib aidata ravida COVID-19, kuid Valge Maja ametliku koronaviiruse töörühma kuuluv dr Anthony Fauci ütles, et keegi ei saa teada, kas hüdroksüklorokiin toimib SARS-CoV-2 vastu. Aprilli alguses teatas New York Times, et president Trumpil on "väike isiklik finantshuvi" Sanofis, ühes hüdroksüklorokiini tootvas ettevõttes, mis tähendab, et kui ettevõte müüks rohkem hüdroksüklorokiini, oleks tal rohkem jõukust.
Aprilli alguses ütles Fauci: "Andmed on tõesti parimal juhul vaid soovituslikud. On olnud juhtumeid, mis näitavad, et mõju võib olla, ja on teisi, mis näitavad, et mõju ei ole." Dr. Megan L. Ranney Browni ülikoolist ütles, et hüdroksüklorokiin võib põhjustada südameinfarkte ja muid probleeme. Teised arstid muretsevad, et kui inimesed võtavad hüdroksüklorokiini COVID-19 puhul, ei jää malaaria, lupuse ja artriidi all kannatavatele inimestele piisavalt. Mõned haiglad on siiski andnud hüdroksüklorokiini COVID-19 patsientidele, kes on väga haiged, sest arstide arvates on see riski väärt.
Teadlased Prantsusmaal ja Hiinas viisid läbi rohkem uuringuid suuremate patsientide rühmadega, kes võtsid hüdroksüklorokiini. Nad jälgisid patsiente, kes võtsid ravimit ja muud ravi koos, ning patsiente, kes võtsid ainult muud ohtu. Mõlemad uuringud näitasid, et hüdroksüklorokiin ei aidanud ja põhjustas kõrvaltoimeid. Mõlemad uuringud avaldati 2020. aasta mais.
Remdesivir
Mõned teadlased arvavad ka, et ravim remdesiviir, mis on leiutatud Ebola raviks, võib toimida SARS-CoV-2 vastu. Remdesiviir toimib teiste viiruste vastu ja seda on juba testitud inimestel, nii et arstid teadsid juba, et see ei tee patsientidele haiget, isegi kui see ei tee neid paremaks. Kuna teadlased juba teadsid, et remdesiviir on ohutu, võisid nad kohe alustada selle katsetamist inimestel.
Arstid andsid 61 COVID-19 patsiendile ravimit nimega remdesiviir, mis tähendab, et nad andsid neile ravimit, kuna muud ravi ei olnud võimalik. Teadlased uurisid 53 neist patsientidest ja leidsid, et 68% patsientidest paranes, 13% suri ja 25%-l esinesid tõsised kõrvaltoimed. Kuid kuna uuringus puudus kontrollrühm, mis tähendab, et neid patsiente ei võrreldud teiste COVID-19 patsientidega, kes ei võtnud remdesiviiri, ja kuna eksperimendis osales ainult 53 inimest, peavad teadlased tegema veel uuringuid, enne kui nad saavad olla kindlad, et remdesiviir toimib.
Remdesiviiri tootva ettevõtte esimees ja tegevjuht David O'Day ütles, et remdesiviir võib mõnel patsiendil toimida paremini kui teistel, ja palus teadlastel teha palju erinevaid uuringuid.
Küsimused ja vastused
K: Mis on SARS-CoV-2?
V: SARS-CoV-2 on positiivse mõttega, üheahelaline RNA-koronaviirus, mis põhjustab haigust COVID-19.
K: Kuidas oli see varem teada?
V: Varem tunti seda Maailma Terviseorganisatsiooni (WHO) poolt 2019. aasta uudse koronaviiruse (2019-nCoV) nime all.
K: Millal teatati esimestest kahtlustatavatest juhtumitest?
V: Esimestest kahtlustatavatest juhtumitest teatati WHO-le 31. detsembril 2019.
K: Kust pärinesid paljud selle uue koronaviiruse esimesed juhtumid?
V: Paljud selle uue koronaviiruse varajased juhtumid olid seotud Huanan Seafood Wholesale Market'iga, mis on suur mereandide ja loomade turg Hiinas Wuhanis.
K: Kas on kindel, et see koht oli pandeemia allikas?
V: Ei, ei ole kindel, et see koht oli pandeemia allikas.
K: Mis tüüpi viirus on SARS-CoV-2?
V: SARS-CoV-2 on positiivse tähendusega üheahelaline RNA-koronaviirus.
K: Millest sai alguse 2019-20 koronaviiruse puhang?
V: Viirus alustas 2019-20 koronaviiruse puhangut.