Positiivse tähendusega üheahelaline RNA-viirus (või (+)ssRNA-viirus) on viirus, mille geneetiline materjal on üheahelaline RNA, mille nukleotiidijärjestus vastab otseselt messenger RNA-le ehk mRNA-le. Erinevalt negatiivse tähendusega viirustest võivad (+)ssRNA-viiruse genoomid olla kohe pärast sisenemist peremeesrakku translatsiooni objektiks: peremeesribosoomid võivad genoomi otse valguks transleerida, ilma et esmalt oleks vaja sünteesida vastassuunalist malli. Üldisemalt võivad üheahelalised RNA-viirused olla kas "positiivse" või "negatiivse" tähendusega — see sõltub RNA polaarsusest ja sellest, kas genoom toimib kohe mRNA-na või peab esmalt sünteesima komplementaarse malli.

Genomeerika ja replikatsioon

(+)ssRNA-viiruste genoomid võivad olla mitmesuguse pikkuse ja organiseeritusastmega: mõnel liigil on üks pikk avatud lugemisraamistik (ORF), mis kodeerib polyvalendi või polyproteiini, mille peremeesraku või viiruslikud proteaasid lõikavad aktiivseteks valkudeks; teistel on mitu eraldiseisvat ORF-i. Paljudel genoomidel on 5' kapa või selle asemel sisemine ribosoomi sisenemise koht (IRES), ning 3' otsas on sageli polü(A)-saba, mis aitab translatsiooni ja stabiilsust.

Viiruse replikatsiooniks peab genoom kodeerima või koos kaasas kandma RNA-sõltuvat RNA-polümeraasi (RdRp). Kuigi genoomi positiivne polaarus lubab kohe translatsiooni, peab RdRp esmalt sünteesima negatiivse malli (−)ssRNA, mis omakorda on templiks uute positiivsete genoomide ja vajalike subgenoomsete mRNAd e jaoks. Sõltuvalt tüübist võib replikatsioon toimuda raku tsütoplasmas või teatud juhtudel raku organellide lähedal ning sageli moodustuvad viirusele iseloomulikud replikatsioonikomplekssid.

Struktuur ja taksonoomia

  • Positiivse tähendusega RNA-viirused kuuluvad Baltimore’i klassifikatsiooni gruppi IV.
  • Nende viirionid võivad olla mantlid (enveloped) või ilma kestata (non-enveloped), kuju varieerub kera- või silindrilisest kaooniliseni.
  • Taksonoomiliselt liigitatakse neid eri perekondadesse (näiteks Picornaviridae, Flaviviridae, Coronaviridae jt), sõltuvalt genoomi ülesehitusest, replikatsioonistrateegiast ja viirioni struktuurist.

Näited ja kliiniline tähendus

Paljud tuntud ja meditsiiniliselt olulised viirused on positiivse tähendusega RNA-viirused, sh hepacivirus C (viiruseperekonda kuuluv, mis põhjustab kroonilist hepatiiti), Lääne-Niiluse viirus, dengue'i viirus, SARS- ja MERS-koronaviirused ning SARS-CoV-2, mis põhjustab COVID-19. Samas on olemas ka sageli vähem tõsiseid või iseeneslikult mööduvaid patogeene, näiteks nohu tekitavad rinoviirused, mis põhjustavad tavalist külmetust.

Diagnostika, profülaktika ja ravi

Diagnostikas kasutatakse laialdaselt nukleiinhapete tuvastamist (nt PCR või qRT-PCR), mis otsib viiruse RNA-d. Vaktsineerimine on tõhus vahend teatud (+)ssRNA-viiruste vastu (näiteks mõned COVID-19 vaktsiinitüübid), ent kõigi nende viiruste jaoks vaktsiine ei ole saadaval (hepacivirus C ehk hepatiit C puhul pole laialt kasutusel vaktsiini). Antiviraalsed ravimid võivad sihtida viiruse proteaase, RdRp-i või teisi elutähtsaid funktsioone; samuti kasutatakse toetavat ravi ja nakkuse leviku tõkestamist.

Kokkuvõte

Positiivse tähendusega üheahelalised RNA-viirused moodustavad mitmekesise ja meditsiiniliselt oluliste liikide rühma. Nende genoomi positiivne polaarus võimaldab kiiret translatsiooni peremeesraku masinavara abil, kuid replikatsioon nõuab tavaliselt viirusspetsiifilist RNA-sõltuvat polümeraasi. Mõned neist viirustest põhjustavad tõsiseid haigusi ja on globaalset tervist ohustavad, teised põhjustavad kergemaid hingamisteede või seedetrakti haigusi.