Integron
Integron on transposooni tüüp, liikuv geneetiline element. See on kaheosaline geneetiline süsteem, mida leidub bakterites ja võib-olla ka laiemalt. See on viis, kuidas antibiootikumiresistentsus nii kiiresti edasi antakse. Seda leidub plasmiidides ja kromosoomides. Kuigi esimene avastatud funktsioon oli antibiootikumiresistentsus, võivad integronid kanda üle ka teisi bakterite funktsioone (omadusi).
Transposoonid on geenide "püüdmis- ja ekspressioonielemendid", mis panevad paika väikesed liikuvad elemendid, mida nimetatakse geenikassettideks, ja panevad need tööle. Tavaliselt on igal kassetil ainult üks geen ja konkreetne rekombinatsioonikoht. Kassetid kannavad (näiteks) antibiootikumiresistentsust kodeerivat DNA-d (= "geeni"). Tavaliselt kodeerib DNA ensüümi, mis lõhustab (lõikab) antibiootikumimolekuli.
Integroni esimene osa on geen, mis kodeerib ensüümi, mis haarab kassette. Teine osa on koht genoomis, kuhu kassetid sisestatakse, ja promootor, mis juhib kassetiga seotud geenide ekspressiooni. "Integron" kirjeldab selliseid struktuure nii kassettide puudumisel kui ka integreeritud kassettide olemasolul. Kassette võib sisestada kohas, neid võib välja lõigata ja nad võivad läbida horisontaalse geenisiirde.
Küsimused ja vastused
K: Mis on integron?
V: Integron on transposooni tüüp, mis on liikuv geneetiline element. Seda leidub bakterites ja võib-olla ka laiemalt ning selle kaudu saab antibiootikumiresistentsus kiiresti edasi kanduda.
K: Kus integronid tavaliselt esinevad?
V: Integroonid esinevad tavaliselt plasmiidides ja kromosoomides.
K: Milline oli integronite esimene avastatud funktsioon?
V: Esimene funktsioon, mis integronite jaoks avastati, oli antibiootikumiresistentsus.
K: Kuidas toimivad geenikassetid integronite puhul?
V: Geenikassettidel on tavaliselt ainult üks geen ja nendega seotud konkreetne rekombinatsioonikoht. Nad kannavad antibiootikumiresistentsust kodeerivat DNA-d, mis kodeerib ensüümi, mis lõhustab (tükeldab) antibiootikumimolekuli. Integroni esimene osa sisaldab geeni, mis kodeerib ensüümi kassettide püüdmiseks, samas kui teine osa sisaldab genoomi kohta, kuhu neid saab sisestada, samuti promootorit, mis juhib kassetiga seotud geenide ekspressiooni.
K: Mis juhtub, kui integronis ei ole ühtegi kassetti?
V: Kui integronis ei ole kassette, kirjeldab see ikkagi selliseid struktuure, isegi kui neid ei integreerita.
K: Kas geenikassette saab integroni sees välja lõigata?
V: Jah, geenikassette saab vajadusel integroni seest välja lõigata.
K: Kas horisontaalne geeniülekanne on võimalik integronites?
V: Jah, horisontaalne geeniülekanne on võimalik integronides, kasutades nende integreeritud geenikassette.
